羊肚菌的播种方法主要有三种：撒播、条播、机播。

1.撒播：撒播的使用较为广泛，首先把农田整理出来畦后，整齐畦面，将掰开揉碎的菌种依照所需要的菌种量立即撒播在畦表面，以后覆土3-5cm。覆土可以使用耙子将菌种与厢表层的土壤层抖混，还可以用翻土机将沟中土翻撒至畦面。

2.条播：条播也是近年来应用较多的播种方法，具备爆发式出菇的特征。具体做法是在畦表面出具20-30cm间隔的小河沟，沟深5-10cm，将掰开揉碎的菌种撒之沟中，以后用铁钉耙将厢表层的土回填土管沟。

3.机播：目前有厂家出羊肚菌播种机，与小麦的播种方法相近，可以实现播种覆土一次完成，更有效率。

播种后原则上应防止菌种外露空气中，但有些地方的土层沙性比较严重，过度疏松，不益于真菌生长发育，应适当在畦面保存一部分菌种，不得超过栽种量20%。